阿米巴經營哲學對阿米巴獎勵機制的設計具有很大的指導意義，同時，阿米巴組織良好的獎勵機制設計，有助于阿米巴經營哲學的落地實踐，達成企業與基層員工雙贏的格局。
1、阿米巴獎勵機制設計所運用的經營哲學
稻盛和夫的經營哲學，主要包括：六項精進、經營十二條、經營為什么需要哲學這三個方面的內容。我們進行阿米巴經營獎勵機制設計，可以參考這些經營哲學精髓。
“六項精進”，是每個人一生中最重要的修煉。《六項精進》濃縮稻盛和夫敬天愛人思想的精髓，為稻盛和夫經營哲學系列著作之一。
“經營十二條”超越國境、超越民族、超越語言差別，是人生成功的鐵則，是經營者的生存智慧，是不可替代的稻盛哲學。信息源:澄海人才網_www.chrcw.cn_雄鷹標志
《經營為什么需要哲學》是稻盛和夫暢談企業長青的秘籍，提出經營需要正確的哲學，它體現在制度規范、思維方式與企業品格等內容上，全面而立體地展現了稻盛和夫經營哲學思想，應用于實踐的深遠影響。
2、阿米巴經營的激勵體系信息源:澄海招聘網_www.chrcw.cn_雄鷹標志
國內許多企業在進行管理模式變革或實施新政策之初，員工的抗拒感比較大，推行有較多阻力。企業在導入阿米巴經營模式時，需要建立阿米巴經營的員工激勵體制。
阿米巴經營模式的重要目標是“人人成為經營者”，企業在追求利益的同時重視員工的幸福感和培養有經營意識的人才，調動員工的積極性。阿米巴是全員參與的經營，它離不開相應激勵體制的建立。而阿米巴組織劃分就是為員工提供機會，讓員工能站在經營者的立場去出發，為經營好阿米巴組織而謀劃。這需要企業給予一定的支持和權力，才能讓員工感到重視，與企業站在同一陣線一起成長，從而在阿米巴之間的形成良性競爭。
阿米巴經營激勵體系是根據現有人力成本來進行核算的，獎金是按收入總額階段進行核算的，在不同的階段對高、中、基層的主要決定作用按比例進行分配。可以看出：
第一，在只完成了目標任務的時候，基層員工獲得獎金最多，說明企業高層管理的決策對增加收入沒起任何作用，此時是基層員工的作用最大，因此這個階段應該給基層員工分配較多獎金;
第二，當實際完成任務超出目標任務一點點的時候，企業高層領導和中層管理者獲得的獎金有所提高，說明在此階段，企業中高層領導人的決策對增加收入起了一定的作用，但還是基層員工起主導作用。
第三，當實際收入大大超出目標收入的時候，企業高層決策者獲得最高的獎金分配，說明在此階段，起決定作用的是企業高層了，因此企業高層應獲得更多的獎金。
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